进水水质主要包括进水pH、水温过低、有机物浓度、悬浮物、存在难降解或抑制类成分等因素。
1、进水pH
进水pH过高或过低都会对生化系统造成影响，导致生化系统无法正常运行甚至系统崩溃，微生物和反硝化菌等没有合适的生存环境。
而这必然会造成系统处理水质能力下降，处理水质恶化，出水各项指标升高。
2、水温过低
过低的水温会使得各种微生物的活性大大降低，以氨氮为首的污染物指标首当其冲的出现浓度上升的趋势，紧跟着的就是总氮、COD等。
3、有机物浓度
进水水质发生变化，有机物浓度过高，进而对活性污泥产生较大影响。
遇到高负荷时，会发现生化池白色泡沫增多，出水在线COD检测仪表数值升高；
在做污泥沉降比时，会发现污泥沉降性能降低，上清液浑浊；
有机物的去除效果降低，好氧区溶解氧下降，化验人员观察生物镜检时会发现原生动物增多。
4、进水存在难降解（或抑制类）成分
发现出水COD升高，有些同行会做闷曝试验：取生化池混合液50L左右，首先取少量混合液沉淀，取上清液过滤测试未进行曝气试验的COD 浓度，然后通过化验室小型曝气机一直闷曝，模拟增加生化系统停留时间，每间隔4小时取少量混合液沉淀测试COD浓度。
5、悬浮物过高
生化系统来水悬浮物偏高，当进水悬浮物过高时，我们在一级处理阶段可通过投加絮凝药剂来增加沉降效果，及时排除沉淀污泥可很快解决。值得一提的是，这个问题不一定是外部因素引起的，也有可能是一级处理工段沉淀的污泥过多未及时进行污泥处理，泥层过高后随废水一道进入生化系统引起的。
